兩棲爬蟲動物館本館包含世界動物區、臺灣兩棲爬蟲動物區與教育解說廊道3個展示區塊，分別展示介紹世界各地與臺灣土地上的兩棲、爬蟲動物，教育解說廊道則介紹兩棲、爬蟲動物的生態與面臨困境。館內還有兩棲爬蟲教室提供相關課程及定期的保姆講古教育解說活動，希望藉由各類動物、寫實模型、互動教材與文化藝品的多元展示，引導遊客進入兩棲爬蟲動物的奧秘世界。
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